O Tribunal Regional Eleitoral de Mato Grosso estabelece horário de expediente das 09 às 19 horas no período de 07 de julho a 19 de outubro, caso haja apenas 1º turno de votação. No caso de ocorrer 2º turno, o horário diferenciado poderá se estender até 16 de novembro.
Os estudos sobre o horário de funcionamento da Secretaria do TRE/MT e dos Cartórios Eleitorais durante os atos preparatórios das Eleições Gerais de 2010 foram realizados pela Presidência, Corregedoria, Diretoria Geral, Assessoria Jurídica, Ouvidoria, Coordenadoria de Controle Interno e Auditoria e Assessores dos Juízes-Membros da Corte, que analisaram diversos aspectos, principalmente a constatação do grande volume de trabalho neste período.
Somam-se aos trabalhos afetos à Secretaria do Tribunal em período de Eleições, os processos de Registros de Candidatura, Propaganda Eleitoral, Análise das Prestações de Contas e Diplomação dos Eleitos.
Além da alteração no horário de funcionamento, o TRE também está funcionando em regime de plantão aos sábados, domingos e feriados, das 14 ás 19 horas. O regime de plantão resulta de exigência legal estabelecida pela Lei Complementar nº 64/90, art. 16.